果然，仅仅几天以后，徐敬业以匡复为名在杨州起兵，起兵之前，还请当时著名的诗人骆宾王写了《为徐敬业讨武氏檄》。这篇文采横溢的文章很快传遍了全国。文中将武太后骂了个狗血喷头。武太后让上官婉儿给她念了这篇文章，面色沉静。看完后她平静地对婉儿说，这是个人才，这样的人才没有被发现和起用，是宰相的失职。朝臣们都被武太后的大气所折服。
武太后并没有急于发兵平叛，她认为这次叛乱的根源正在朝中，先绝根，后斩蔓才是上策。
武太后将中书令裴炎召到内宫的英贤殿，与他商量平息叛乱一事。早在中宗被废之时，武太后即对裴炎大失所望。尤其是当武承嗣请求准许建立武氏七庙以追尊武氏宗族时，裴炎表示了强烈的反对。他以不容置疑的口吻说自古以来，尊崇内戚往往导致国破家败，汉朝的吕后即是一例。裴炎将自己与吕后相提并论，在武太后的心中留下了难以除去的刺痛。尤其是一想到太子贤的自杀，武太后心里在更中怒不可遏。她毫不犹豫地将宰相裴炎斩于都亭。朝臣们不禁感到奇怪，武太后这才说出谜底，当年怂恿李贤谋为不轨，之后又暗使人逼李贤自杀的，都是这个裴炎。人们这才明白武太后有多强的忍耐力。
之后，武太后命令李孝逸发兵讨伐徐敬业，徐敬业造反很快就被平息了，而武太后并没显出多么欣喜，她对朝臣们说，和我又失去了一个儿子比起来，这一切都太微不足道了。
武太后下令，凡有上堂诉冤者，御史一律不得搁置，要马上处理。另外，她隆重地颁行《求贤制》，允许天下有德有才之人向朝廷自举。然后亲自写下文章，普赐臣僚，让朝臣知道什么是为臣之道。